北海档案馆拥有一批珍贵的历史档案，具有较高的档案保存价值及历史参考价值，是北海档案馆的镇馆之宝。这批档案中既有德国占领青岛时期的进行潮汐和海流观测的资料，也有民国时期进行潮汐观测的记录，其中最早的档案是1904年-1905年德意志皇家建设局海事部门的潮汐观测记录《满于潮观测》。

　　北海档案馆馆藏珍贵档案中还包括建局以来各时期海洋重大项目和重要任务中产生的原始资料、科研成果、刊物等，充分体现了作为海洋人勇于探险拼搏、艰苦工作中的方方面面和取得的辉煌业绩。